En este código comprobamos si el importe es igual o mayor que 100 para personalizar el pedido. No olvides modificar la cantidad para tu caso.

/* Email personalizado si el pedido supera un importe */
add_action('woocommerce_email_order_details', 'ayudawp_email_segun_importe', 1, 4);

function ayudawp_email_segun_importe($order, $admin, $plain, $email) {
    $total = $order - > get_total();
    $status = $order - > get_status();
    // definimos el importe del pedido que lanza el mensaje 
    if ($total >= 100) {
        // definimos el estado necesario del pedido
        if ($status == "completed") {
            // aplicamos el mensaje personalizado en formato traducible por WP
            echo __('<strong>Descuento para tu próxima compra:</strong> Gracias por tu confianza.
                Para futuras compras puedes obtener un descuento en < a href = "#" > nuestra tienda < /a>.', 'ayudawp' );
        }
    }
}

Herramientas